为了拯救武祯，梅逐雨带着她前往渠州寻找仙草。在那里，梅逐雨借助秘术回到了 18 年前。通过时空回溯，梅逐雨惊讶地发现，自己的父亲梅崇允竟然就是前任猫公。他还看到了父亲当年救下少女武祯的场景，至此，梅逐雨才知晓自己继承了猫族血脉。
而在梅逐雨为拯救武祯而努力时，武祯也恢复了县主身份。她日夜悉心照顾着陷入沉睡的夫君，满心期盼着他能早日苏醒。待梅逐雨醒来，剧情迎来了令人惊喜的转变，武祯晋升为全妖，力量得到了极大增强，然而她却依旧保留着原本的性格本色。梅逐雨则成为了猫公，这一身份的转变，成功解决了他们人妖殊途的困境以及寿命差异的难题，让两人得以实现永久相守，甚至还孕育了新生命，开启了全新的生活篇章。
苏醒后的梅逐雨对武祯展现出了极致的宠爱。因武祯怀孕，他疯狂采购各种食物，那急切又紧张的模样，被长安市民看在眼里，不禁调侃 “遇猫公必见梅司使” ，这强烈的反差萌，让观众看到了梅逐雨对武祯深深的爱意。更令人意想不到的是，梅逐雨通过秘术与武祯灵魂互换，以男子之躯替武祯怀孕并生下孩子。在这一过程中，梅逐雨亲身体验到了怀孕的种种艰辛，深刻理解了武祯此前所做出的牺牲。
以往的古装剧中，鲜少有这样的情节设定，男主怀孕生子这一情节无疑给观众带来了极大的冲击。通过这一情节，梅逐雨不再仅仅是站在一旁空言关心，而是真正设身处地地感受武祯的痛苦，这种体验让他们的感情更加深厚。
结局固然圆满，但也引发了一些争议。部分观众认为 “猫公之位传男主” 的设定，在一定程度上削弱了武祯的领袖感，使她前期的强大形象有所弱化。而且婚后剧情中两人偶尔产生的 “怨偶感”，与原著中温情脉脉的基调有所偏离，让一些原著粉丝感到失望。不过，这也从侧面反映出观众对这部剧的关注度和期待值之高。
总的来说，《子夜归》的大结局凭借独特的情节设定，尤其是男主怀孕这一创新点，给观众留下了深刻的印象，为古装剧的剧情发展开拓了新的思路。
